Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chmp5Q9D7S9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms