Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chmp4cQ9D7F7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chmp4cQ9D7F7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms