Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ndufb8Q9D6J5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb8Q9D6J5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms