Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6H2

Hspb11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb11Q9D6H2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hspb11Q9D6H2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hspb11Q9D6H2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms