Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabra4Q9D6F4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms