Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sf3a3Q9D554 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sf3a3Q9D554 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms