Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tomm20lQ9D4V6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tomm20lQ9D4V6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms