Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
4930556J24RikQ9D4U7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
4930556J24RikQ9D4U7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms