Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930578G10RikQ9D4Q4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930578G10RikQ9D4Q4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms