Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ribc2Q9D4Q1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ribc2Q9D4Q1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms