Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rsph14Q9D3W1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms