Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stag1Q9D3E6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stag1Q9D3E6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stag1Q9D3E6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Stag1Q9D3E6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stag1Q9D3E6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stag1Q9D3E6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stag1Q9D3E6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stag1Q9D3E6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stag1Q9D3E6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stag1Q9D3E6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stag1Q9D3E6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Stag1Q9D3E6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Stag1Q9D3E6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms