Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l4Q9D2A5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l4Q9D2A5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l4Q9D2A5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l4Q9D2A5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l4Q9D2A5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l4Q9D2A5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l4Q9D2A5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Creb3l4Q9D2A5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Creb3l4Q9D2A5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Creb3l4Q9D2A5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Creb3l4Q9D2A5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms