Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms