Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X9

Tmem50b, Transmembrane protein 50B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50bQ9D1X9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem50bQ9D1X9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50bQ9D1X9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms