Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nol3Q9D1X0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nol3Q9D1X0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms