Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Lingo1Q9D1T0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lingo1Q9D1T0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms