Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab1bQ9D1G1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab1bQ9D1G1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab1bQ9D1G1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab1bQ9D1G1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab1bQ9D1G1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1bQ9D1G1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1bQ9D1G1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1bQ9D1G1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1bQ9D1G1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab1bQ9D1G1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms