Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms