Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Syf2Q9D198 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms