Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc47Q9D024 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc47Q9D024 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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