Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2610524H06RikQ9CZU9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610524H06RikQ9CZU9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms