Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nde1Q9CZA6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms