Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed5Q9CXE7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms