Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mgme1Q9CXC3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mgme1Q9CXC3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms