Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmd8Q9CX56 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmd8Q9CX56 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmd8Q9CX56 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Psmd8Q9CX56 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmd8Q9CX56 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmd8Q9CX56 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmd8Q9CX56 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmd8Q9CX56 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmd8Q9CX56 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmd8Q9CX56 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmd8Q9CX56 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmd8Q9CX56 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmd8Q9CX56 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Psmd8Q9CX56 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd8Q9CX56 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms