Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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RpainQ9CWY9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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RpainQ9CWY9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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RpainQ9CWY9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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RpainQ9CWY9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RpainQ9CWY9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RpainQ9CWY9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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