Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpusd4Q9CWX4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpusd4Q9CWX4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms