Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn3Q9CVD2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms