Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Sycp2Q9CUU3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Sycp2Q9CUU3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sycp2Q9CUU3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms