Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930553M12RikQ9CUH1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms