Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atp5sQ9CRA7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atp5sQ9CRA7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms