Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CR55 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9CR55 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9CR55 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9CR55 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9CR55 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CR55 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CR55 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CR55 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9CR55 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
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