Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NmbQ9CR53 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NmbQ9CR53 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms