Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms