Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ankrd1Q9CR42 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd1Q9CR42 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd1Q9CR42 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms