Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR41

Hypk, Huntingtin-interacting protein K, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HypkQ9CR41 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HypkQ9CR41 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HypkQ9CR41 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HypkQ9CR41 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HypkQ9CR41 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HypkQ9CR41 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms