Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
4931417E11RikQ9CR05 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4931417E11RikQ9CR05 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms