Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rer1Q9CQU3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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