Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim8Q9CQQ0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Smim8Q9CQQ0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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