Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rdm1Q9CQK3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdm1Q9CQK3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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