Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndufb9Q9CQJ8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndufb9Q9CQJ8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms