Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Higd2aQ9CQJ1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Higd2aQ9CQJ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms