Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nudt21Q9CQF3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms