Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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