Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Chchd1Q9CQA6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Chchd1Q9CQA6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Chchd1Q9CQA6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Chchd1Q9CQA6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Chchd1Q9CQA6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Chchd1Q9CQA6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Chchd1Q9CQA6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Chchd1Q9CQA6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms