Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc5Q9CQA1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc5Q9CQA1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms