Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CQ90 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQ90 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms