Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Itgb3bpQ9CQ82 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb3bpQ9CQ82 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms