Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
4921530L21RikQ9CQ47 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4921530L21RikQ9CQ47 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms